RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRM2BQ7LG56 351 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJC3Q8NFK1 279 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERGIC1Q969X5 290 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TECTBQ96PL2 329 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCAR1Q9BXC0 346 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD19PQ9H560 264 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGLEC7Q9Y286 467 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHFPL6Q9Y693 200 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF879B4DU55 563 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RY10O00398 339 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOCS2O14508 198 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM20BO75063 409 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF682O95780 498 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP9P14780 707 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD200P41217 278 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCD1Q15116 288 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEP1BQ16820 701 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNM1P34Q6PK57 102 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COLCA1Q6ZS62 124 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBX15Q96SF7 602 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSZQ9UBR2 303 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS6KA6Q9UK32 745 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTP4A3O75365 173 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT34O76011 436 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOX4O94842 621 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP10-3P60369 221 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX10Q12887 443 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD276Q5ZPR3 534 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CORO6Q6QEF8 472 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF620Q6ZNG0 422 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBLL1Q75N03 491 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GATAD2BQ8WXI9 593 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYRK2Q92630 601 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSSK2Q96PF2 358 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKP2Q99959 881 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAR1AQ9NR31 198 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMTM6Q9NX76 183 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVK-18Q9QC07 812 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa10.93□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCTN6O00399 190 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCR6O00574 342 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNDC12O95881 172 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIPFP07098 398 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSM4P0C7M7 580 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRABP1P29762 137 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPAP49450 140 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS6KA3P51812 740 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FXYD6P3P58550 94 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ8Q15842 424 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP9P1Q75LS8 142 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARPINQ7Z6K5 226 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP4Z1Q86W10 505 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D15Q8TC07 691 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2FQ969M7 185 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACOXLQ9NUZ1 547 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMCX1Q9P291 453 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF7Q9UBF6 113 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF114Q9Y508 228 aa10.92□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F5H5K5 113 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGALS8O00214 317 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR137BO60478 399 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINA1P01009 418 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OMPP47874 163 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIPEQ05469 1076 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MALLQ13021 153 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPPED2Q15777 294 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL11BQ5VVY1 283 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC18B1Q6NT16 456 aa10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms