RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52N4Q8NGI2 321 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB10Q8WXI3 467 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 AQP3Q92482 292 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGDIBP52566 201 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52H1Q8NGJ2 320 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R3Q9NYW6 316 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 AVPR2P30518 371 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DLSTP36957 453 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC119Q13432 240 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MEF2DQ14814 521 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OGFOD3Q6PK18 319 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LYPD6Q86Y78 171 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 NKAIN3Q8N8D7 197 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MRGPRFQ96AM1 343 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PRRT1Q99946 306 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 VDAC3Q9Y277 283 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN9O75954 239 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB25P24278 435 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 BDKRB2P30411 391 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LYG2Q86SG7 212 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RTN4RL2Q86UN3 420 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXW5Q969U6 566 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 EMC6Q9BV81 110 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB22AQ9UL26 194 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF222A6NCQ9 220 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 VAMP1P23763 118 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CD96P40200 585 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 IL13RA1P78552 427 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD11B2P80365 405 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LPCAT3Q6P1A2 487 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF813Q6ZN06 617 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A42Q86VD7 318 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MVB12AQ96EY5 273 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GW55 424 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 A6NIZ1 184 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL2L11O43521 198 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX4L2P0CJ85 424 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX4L3P0CJ86 424 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX4L4P0CJ87 422 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX4L5P0CJ88 424 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX4L6P0CJ89 424 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX4L7P0CJ90 424 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 GNB3P16520 340 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 HRH1P35367 487 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RAP1BP61224 184 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RAP1AP62834 184 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFA5Q01523 94 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-BQ31612 363 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM122CQ6P4D5 195 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD9Q7L273 389 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PTX4Q96A99 478 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX4Q9UBX2 424 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNAB3O43448 404 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMTOR5O43504 91 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGLEC6O43699 453 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 STK17BO94768 372 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2F2O95006 317 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1C4P17516 323 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB6AP20340 208 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZXDAP98168 799 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2F1Q13607 317 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB12Q6IQ22 244 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEAL3Q969E4 200 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf34Q96MH7 638 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK17Q96T54 332 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSFQ9UBX1 484 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SUSD2Q9UGT4 822 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MED12Q93074 2177 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf170A2RU37 121 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SHISA8B8ZZ34 492 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TOR1AO14656 332 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX1O43812 170 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A4P12235 298 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXW4P57775 412 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TLE3Q04726 772 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PMS2CLQ68D20 193 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms