RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 A8MV72 311 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 PRODHO43272 600 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFSF4P23510 183 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC15A1P46059 708 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKXP51817 358 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35D3Q5M8T2 416 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 DRAM2Q6UX65 266 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8G5Q8NG78 346 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL17Q92583 94 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 PKP2Q99959 881 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 OAZ3Q9UMX2 235 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 HIVEP2P31629 2446 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CR1P17927 2039 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF878C9JN71 531 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SELEP16581 610 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC2A5P22732 501 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 EPHA2P29317 976 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 IL2RGP31785 369 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS7P62081 194 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 C10orf67Q8IYJ2 551 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 OR13G1Q8NGZ3 307 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 HPS1Q92902 700 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TEAD3Q99594 435 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SOX7Q9BT81 388 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SAC3D1A6NKF1 404 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ZAR1LA6NP61 321 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 IQCF6A8MYZ5 107 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BNX3 289 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT9BO14905 357 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKYO43930 277 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SELENOFO60613 162 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 GRB2P62993 217 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 EFNB1P98172 346 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 APOFQ13790 326 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAI3Q3KNW1 292 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SLX4IPQ5VYV7 408 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP1Q6P2D0 407 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 PGAP1Q75T13 922 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF283Q8N7M2 679 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 THEM6Q8WUY1 208 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF133Q8WVZ7 376 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 CIB1Q99828 191 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 NARFLQ9H6Q4 476 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM100Q9NV29 134 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 IL19Q9UHD0 177 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ENOPH1Q9UHY7 261 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA1O95477 2261 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TLN2Q9Y4G6 2542 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 C2CD3Q4AC94 2353 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 C5orf63A6NC05 138 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 CRLF1O75462 422 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TGFAP01135 160 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 IGFBP5P24593 272 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS12P56730 875 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 MVKQ03426 396 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 AVPI1Q5T686 147 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOUQ7L0Q8 258 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF454Q8N9F8 522 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 BHLHE23Q8NDY6 225 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 CLDND2Q8NHS1 167 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 OTOSQ8NHW6 89 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 AMELYQ99218 206 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC30A2Q9BRI3 323 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 OSBPL10Q9BXB5 764 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TOR3AQ9H497 397 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 FN1P02751 2386 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 CLDN25C9JDP6 229 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 H0YL77 283 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC2A1P11166 492 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF1AP19438 455 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ANOS1P23352 680 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 HSD11B1P28845 292 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 HCCSP53701 268 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF92Q03936 586 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC3A1Q07837 685 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf73Q69YU5 71 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TCEANCQ8N8B7 351 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB1CQ92928 201 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC182A6NF36 153 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 LMX1BO60663 402 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 APOC1P02654 83 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 LYNP07948 512 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 H2BFMP0C1H6 154 aa17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms