RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 GCM1Q9NP62 436 aa14.48□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.48□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DHRS12A0PJE2 317 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 TVP23AA6NH52 213 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 H3BN98 237 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 CST1P01037 141 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 SPARCP09486 303 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 T-ENOLP0DO92 83 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 IRF2P14316 349 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 ENTPD1P49961 510 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 LCN2P80188 198 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 CRMP1Q14194 572 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 GIPC3Q8TF64 312 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 MAP6Q96JE9 813 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DDOQ99489 341 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 CHID1Q9BWS9 393 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 SLC22A4Q9H015 551 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.47□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 AQP12BA6NM10 295 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 PPIAL4DF5H284 164 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 TMEM178BH3BS89 294 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 GYG2O15488 501 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 CPT2P23786 658 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 MMP16P51512 607 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 ESCO2Q56NI9 601 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DRAM2Q6UX65 266 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 NANPQ8TBE9 248 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 VNN3Q9NY84 501 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 DYSFO75923 2080 aa14.46□□□□□ -0.09
USP11-202ENST00000377078 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 E2F6O75461 281 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 SPI1P17947 270 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 EPHA1P21709 976 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 SLC15A1P46059 708 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 ZMYND11Q15326 602 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 ERGIC1Q969X5 290 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 JMJD8Q96S16 334 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 FEVQ99581 238 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 TEX12Q9BXU0 123 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 OPA3Q9H6K4 179 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 CMC2Q9NRP2 79 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 CENPMQ9NSP4 180 aa14.45□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 ZNF878C9JN71 531 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 ACOT8O14734 319 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 GYPBP06028 91 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 FLOT2Q14254 428 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 OR8G1Q15617 311 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 TEX30Q5JUR7 227 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 MOGAT3Q86VF5 341 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 SPATA24Q86W54 205 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 OTULINQ96BN8 352 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 KCNJ15Q99712 375 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 SP140LQ9H930 580 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.44□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 A0A1B0GWJ7 208 aa14.43□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 GGT3PA6NGU5 568 aa14.43□□□□□ -0.1
USP11-202ENST00000377078 F5H5P2 479 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms