RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa25.64■■□□□ 1.7
ECHS1-201ENST00000368547 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
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ECHS1-201ENST00000368547 SSR3Q9UNL2 185 aa25.64■■□□□ 1.7
ECHS1-201ENST00000368547 LOC100509620A0A075B734 347 aa25.63■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 NCS1P62166 190 aa25.63■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 RPS4Y2Q8TD47 263 aa25.63■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 CD40P25942 277 aa25.61■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 MS4A15Q8N5U1 240 aa25.6■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC24A3Q9HC58 644 aa25.6■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 LRP12Q9Y561 859 aa25.6■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa25.59■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa25.59■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 ARL9Q6T311 187 aa25.59■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 TSC22D3Q99576 134 aa25.59■■□□□ 1.69
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ECHS1-201ENST00000368547 CDH20Q9HBT6 801 aa25.59■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB108AA8MXU0 73 aa25.58■■□□□ 1.69
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