RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365563.1

RNU6-54P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 54, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-54P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-54P-201ENST00000365563 VWFP04275 2813 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRAV34A0A0B4J273 112 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 A0A0B4J2C4 111 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 A0A1W2PNV4 684 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCDC69A6NI79 296 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 J3QQQ9 107 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TAAR5O14804 337 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 LRATO95237 230 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 IGF1P05019 195 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 IL11P20809 199 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 KDELR1P24390 212 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 HOXA6P31267 233 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAP3K8P41279 467 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NSG1P42857 185 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RORCP51449 518 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 XKP51811 444 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SNU13P55769 128 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RPL26P61254 145 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PNOCQ13519 176 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 QPRTQ15274 297 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RALBP1Q15311 655 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZBTB6Q15916 424 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TPRXLQ17RH7 258 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 KCTD21Q4G0X4 260 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CARD16Q5EG05 197 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 C10orf99Q6UWK7 81 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM159AQ6UWV7 190 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRSS42Q7Z5A4 293 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMEM144Q7Z5S9 345 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MDP1Q86V88 176 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM58AQ8N1B3 248 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF738Q8NE65 137 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR4X2Q8NGF9 303 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PYROXD1Q8WU10 500 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 UFD1Q92890 307 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMEM54Q969K7 222 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MYLPFQ96A32 169 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC41A3Q96GZ6 507 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ACTR8Q9H981 624 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM60AQ9NP50 221 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 P2RX2Q9UBL9 471 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC7A8Q9UHI5 535 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RASD1Q9Y272 281 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MYCBP2O75592 4640 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 UBE4BO95155 1302 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MEIKINA0A087WXM9 373 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TSPAN11A1L157 253 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ISPDA4D126 451 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC22A20A6NK97 555 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 A8MUN3 132 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TNFRSF11BO00300 401 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 UBE2CO00762 179 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ERGP11308 486 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PAX6P26367 422 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CRABP2P29373 138 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PPP5CP53041 499 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF33AQ06730 810 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR5I1Q13606 314 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAPK6Q16659 721 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 HECTD3Q5T447 861 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCDC70Q6NSX1 233 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ENPP6Q6UWR7 440 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PET117Q6UWS5 81 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 HOOK3Q86VS8 718 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC25A29Q8N8R3 303 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ENKURQ8TC29 256 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRT35Q92764 455 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CLDN23Q96B33 292 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC35G5Q96KT7 338 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 C12orf66Q96MD2 445 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 VSTM2LQ96N03 204 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 Q9BRP9 147 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ABCB9Q9NP78 766 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms