RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 LAX1Q8IWV1 398 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 HTRA1Q92743 480 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO17Q96EF6 278 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CMTM3Q96MX0 182 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3GL3Q99963 347 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF121Q9H920 327 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTBN2O15020 2390 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FREM3P0C091 2139 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JK05 382 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RY10O00398 339 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 HPGDSO60760 199 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 UPK1BO75841 260 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-9P01782 118 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TTRP02766 147 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 MAS1P04201 325 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSM4P0C7M7 580 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A9P48067 706 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS3P57727 454 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFA1P59665 94 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFA3P59666 94 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TBR1Q16650 682 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RGS21Q2M5E4 152 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF627Q7L945 461 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 COMMD2Q86X83 199 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PGAM5Q96HS1 289 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TAAR6Q96RI8 345 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIB1Q96RU8 372 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA2Q9UM82 520 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WV48 116 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6C6A6NF89 314 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BSH0 61 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R135 149 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 APOA1P02647 267 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CALCBP10092 127 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRA1P14867 456 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF32P17041 273 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 MPGP29372 298 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGER4P35408 488 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ARR3P36575 388 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 GNALP38405 381 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR3A2P47893 321 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TGFBR3Q03167 851 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAPQ12884 760 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PYDC2Q56P42 97 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CNIH2Q6PI25 160 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DRAM2Q6UX65 266 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM57BQ71RH2 274 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DOK3Q7L591 496 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 LINGO2Q7L985 606 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SKA3Q8IX90 412 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8H2Q8N162 312 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51E1Q8TCB6 317 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FGGYQ96C11 551 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ORAI1Q96D31 301 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF799Q96GE5 643 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10A2Q9H208 303 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CYSLTR2Q9NS75 346 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0U1RQV5 110 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX1O43435 398 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNGR3O43761 229 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DOK2O60496 412 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms