RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294613.9

TM2D1-201, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D1, Length 1,250 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-201ENST00000294613 ECH1Q13011 328 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 OR8G5Q8NG78 346 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 GAL3ST1Q99999 423 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.56□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 ISPDA4D126 451 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 H3BN98 237 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SELEP16581 610 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 TNFSF4P23510 183 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 PHC2Q8IXK0 858 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 RAB1CQ92928 201 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 RAB39BQ96DA2 213 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 TIMD4Q96H15 378 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 NTN4Q9HB63 628 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 IL19Q9UHD0 177 aa14.55□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 F5H5P2 479 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 GSC2O15499 205 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 PLPP2O43688 288 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 E2F6O75461 281 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 IFNGP01579 166 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 LCATP04180 440 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 PRKACGP22612 351 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SLC6A9P48067 706 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 ZMYND11Q15326 602 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 TEX30Q5JUR7 227 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 AMELYQ99218 206 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 COPS4Q9BT78 406 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 GCM1Q9NP62 436 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 NPTNQ9Y639 398 aa14.54□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 GNGT2O14610 69 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 TIPRLO75663 272 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 HLA-DPB1P04440 258 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SLC2A1P11166 492 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 TNFRSF1AP19438 455 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 POU1F1P28069 291 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 FMO3P31513 532 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 TPTEP56180 551 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF92Q03936 586 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SLC3A1Q07837 685 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SPATC1Q76KD6 591 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 SPTSSAQ969W0 71 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 MARCH7Q9H992 704 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.53□□□□□ -0.08
TM2D1-201ENST00000294613 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 RNF212BA8MTL3 300 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF878C9JN71 531 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 SURF4O15260 269 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 PNPP00491 289 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 AVPP01185 164 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 OSMP13725 252 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 THBS2P35442 1172 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 BTG1P62324 171 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 GINS1Q14691 196 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 TIGD4Q8IY51 512 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 TMEM178BH3BS89 294 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 PCMT1P22061 227 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 PRKXP51817 358 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 CDK5Q00535 292 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 FAHD1Q6P587 224 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 DRAM2Q6UX65 266 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 PGAP1Q75T13 922 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 OTULINQ96BN8 352 aa14.51□□□□□ -0.09
TM2D1-201ENST00000294613 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms