RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269318.9

CCDC40-201, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCDC40, Length 1,970 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-201ENST00000269318 VASH2Q86V25 355 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TMEM45BQ96B21 275 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GPR84Q9NQS5 396 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ARSBP15848 533 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 BDKRB2P30411 391 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 PLGLB1Q02325 96 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 KLK11Q9UBX7 282 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ALG5Q9Y673 324 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 C5orf63A6NC05 138 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ACOT7O00154 380 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GNALP38405 381 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 RRADP55042 308 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 BTG1P62324 171 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 NAA40Q86UY6 237 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SLC7A6Q92536 515 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 HAS2Q92819 552 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TNFRSF10AO00220 468 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 NKX2-8O15522 239 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 KDM4BO94953 1096 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CST2P09228 141 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GABRA1P14867 456 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CD46P15529 392 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 NBL1P41271 181 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SRYQ05066 204 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SCMH1Q96GD3 660 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 MT-ND4P03905 459 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ITGB2P05107 769 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ABOP16442 354 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 RAB3AP20336 220 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GIFP27352 417 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 BCL2A1Q16548 175 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 DOK3Q7L591 496 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 DIABLOQ9NR28 239 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 F5H5K5 113 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TCRBP04435 133 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ZNF20P17024 532 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 COMMD2Q86X83 199 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 MEIOBQ8N635 442 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 PTX4Q96A99 478 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 PGAM5Q96HS1 289 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 LYZL4Q96KX0 146 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GPR35Q9HC97 309 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 COPZ2Q9P299 210 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 A0A0U1RQV5 110 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 B4GALT1P15291 398 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 WT1P19544 449 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CRYGSP22914 178 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CCR6P51684 374 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 AP3S2P59780 193 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ARG2P78540 354 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 RAB35Q15286 201 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 Q6ZSR3 168 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR5AS1Q8N127 324 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms