RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF721Q8TF20 911 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB13Q8WXK3 278 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ST8SIA1Q92185 356 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HGDQ93099 445 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TAAR8Q969N4 342 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 OMA1Q96E52 524 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GHITMQ9H3K2 345 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPB11Q9Y547 144 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0A6YYH2 397 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS37A4D1T9 235 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NJ64 397 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOD1A6NK06 481 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF212BA8MTL3 300 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 DVL2O14641 736 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRG2O14669 202 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 FABP7O15540 132 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 XRCC3O43542 346 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SUSD5O60279 629 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 UPK3AO75631 287 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SCGNO76038 276 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFPL1O95159 310 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 F13BP05160 661 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINA7P05543 415 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 CYC1P08574 325 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF823P16415 610 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NAGAP17050 411 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ALOX5APP20292 161 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 CFPP27918 469 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 BTCP35070 178 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR2BP41595 481 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R20P59543 309 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTBP60709 375 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTG1P63261 375 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF117Q03924 483 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZP4Q12836 540 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC17A1Q14916 467 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB11BQ15907 218 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GSG1Q2KHT4 349 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MESTQ5EB52 335 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SPICQ8N5J4 248 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 OTOSQ8NHW6 89 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF128Q8TEB7 428 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8B4Q96RC9 309 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 B9D1Q9UPM9 204 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 DHDHQ9UQ10 334 aa6.24□□□□□ -1.41
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