RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.66□□□□□ -1.5
SGIP1-201ENST00000237247 FOXS1O43638 330 aa5.66□□□□□ -1.5
SGIP1-201ENST00000237247 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SGIP1-201ENST00000237247 CEACAM5P06731 702 aa5.66□□□□□ -1.5
SGIP1-201ENST00000237247 TBPP20226 339 aa5.66□□□□□ -1.5
SGIP1-201ENST00000237247 DCTDP32321 178 aa5.66□□□□□ -1.5
SGIP1-201ENST00000237247 RABIFP47224 123 aa5.66□□□□□ -1.5
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SGIP1-201ENST00000237247 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.66□□□□□ -1.5
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SGIP1-201ENST00000237247 ZNF774Q6NX45 483 aa5.65□□□□□ -1.5
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SGIP1-201ENST00000237247 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.65□□□□□ -1.5
SGIP1-201ENST00000237247 NRTNQ99748 197 aa5.65□□□□□ -1.5
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SGIP1-201ENST00000237247 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.65□□□□□ -1.51
SGIP1-201ENST00000237247 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SGIP1-201ENST00000237247 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.65□□□□□ -1.51
SGIP1-201ENST00000237247 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
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