RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NTN4Q9HB63 628 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 A6NIN4 97 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PDGFAP04085 211 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 COX5AP20674 150 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PRRX2Q99811 253 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 HS3ST1O14792 307 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CLEC3BP05452 202 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 LIPNQ5VXI9 398 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 EDEM2Q9BV94 578 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 LANCL2Q9NS86 450 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SMIM18P0DKX4 95 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MPPED2Q15777 294 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 GINS3Q9BRX5 216 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 G3V3Y1 287 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TNFSF11O14788 317 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CYTIPO60759 359 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FBP1P09467 338 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF385BQ569K4 471 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OSR2Q8N2R0 312 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PP6455Q8WZ26 134 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MED9Q9NWA0 146 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 C5orf49A4QMS7 147 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR5H15A6NDH6 313 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR5H14A6NHG9 310 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR5H1A6NKK0 313 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 K7ESM1 405 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FZD6O60353 706 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RAB5AP20339 215 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 F2RP25116 425 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 IL11RAQ14626 422 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SPSB1Q96BD6 273 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MENTQ9BUN1 341 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR51I2Q9H344 312 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CHEK1O14757 476 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ARPC3O15145 178 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 EMDP50402 254 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 UQCC3Q6UW78 93 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SEC22AQ96IW7 307 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM202A6NGA9 273 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 HRO43593 1189 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 F10P00742 488 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CPN1P15169 458 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 GPR84Q9NQS5 396 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.54□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CBY3A6NI87 242 aa6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 IFITM5A6NNB3 132 aa6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SIRPB1O00241 398 aa6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMPRSS11DO60235 418 aa6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TNFRSF1AP19438 455 aa6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ALOX5APP20292 161 aa6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 GABRA4P48169 554 aa6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 KCNJ3P48549 501 aa6.53□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MMP15P51511 669 aa6.53□□□□□ -1.36
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