RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHST4Q8NCG5 386 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF138Q8WVD3 245 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNRHR2Q96P88 292 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2A7Q96R45 310 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLK13Q9UKR3 277 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2QL1A1L167 161 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGA4P0DJD7 388 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGA3P0DJD8 388 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PNLIPP16233 465 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNC119Q13432 240 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OPCMLQ14982 345 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ESCO2Q56NI9 601 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52W1Q6IF63 320 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4K17Q8NGC6 315 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFI44Q8TCB0 444 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SFXN2Q96NB2 322 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC17A5Q9NRA2 495 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PILRBQ9UKJ0 227 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEGF11A6BM72 1044 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTLL8A6PVC2 850 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GABRA1P14867 456 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BDKRB2P30411 391 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEGS2Q6QHC5 323 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OPN4Q9UHM6 478 aa10.47□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5orf63A6NC05 138 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB27BO00194 218 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPPPO94811 219 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYB5AP00167 134 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHG1P01857 330 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 QDPRP09417 244 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF43P17038 809 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLX5P56178 289 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLDN6P56747 220 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTBP60709 375 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAP2BP61225 183 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTG1P63261 375 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THEM4Q5T1C6 240 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf88Q6PI97 169 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC22A8Q8TCC7 542 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC6A7Q99884 636 aa10.46□□□□□ -0.73
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PNV4 684 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPIPB13A6NJU9 1138 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPIPB4C9JG80 1138 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 L7N2F9 121 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SULT2B1O00204 365 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DKK1O94907 266 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFNA7P01567 189 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD37P11049 281 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSX1P28360 303 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSD11B1P28845 292 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R19P59542 299 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF13Q15543 124 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A53Q5H9E4 307 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PMS2CLQ68D20 193 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAA40Q86UY6 237 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOXO1Q8NFA2 376 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MR1Q95460 341 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBQLN2Q9UHD9 624 aa10.46□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GTI1 187 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 E9PLN8 166 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VSIG8P0DPA2 414 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNB3P16520 340 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCOLCEQ15113 449 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANGPTL5Q86XS5 388 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1M1Q8NGA1 313 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELP5Q8TE02 316 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC39A7Q92504 469 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM82A0PJX8 343 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGB2P05107 769 aa10.45□□□□□ -0.74
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UMODP07911 640 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms