RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 NDUFAF7Q7L592 441 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 STK35Q8TDR2 534 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa13.49□□□□□ -0.25
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CTIF-205ENST00000587860 FOXJ3Q9UPW0 622 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 EMC9Q9Y3B6 208 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 LOC100509620A0A075B734 347 aa13.48□□□□□ -0.25
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CTIF-205ENST00000587860 TRAV18A0A075B6X5 111 aa13.48□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PNR3 127 aa13.48□□□□□ -0.25
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CTIF-205ENST00000587860 SLC2A1P11166 492 aa13.48□□□□□ -0.25
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CTIF-205ENST00000587860 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa13.47□□□□□ -0.25
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CTIF-205ENST00000587860 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 DCXRQ7Z4W1 244 aa13.46□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 TMEM185AQ8NFB2 350 aa13.46□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 OR56B4Q8NH76 319 aa13.46□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 C14orf144Q96I85 54 aa13.46□□□□□ -0.25
CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PPE3 182 aa13.46□□□□□ -0.26
CTIF-205ENST00000587860 SLC31A2O15432 143 aa13.46□□□□□ -0.26
CTIF-205ENST00000587860 FADS1O60427 444 aa13.46□□□□□ -0.26
CTIF-205ENST00000587860 OR2J2O76002 312 aa13.46□□□□□ -0.26
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