RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TAF13Q15543 124 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 LIPNQ5VXI9 398 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 NAA40Q86UY6 237 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SPARTQ8N0X7 666 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 FAM222BQ8WU58 562 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SPTSSAQ969W0 71 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF799Q96GE5 643 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 DOK1Q99704 481 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 NIPAL2Q9H841 368 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 CDH20Q9HBT6 801 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 NGBQ9NPG2 151 aa14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 J3QLW9 94 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ICMTO60725 284 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PNPP00491 289 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 LALBAP00709 142 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SMIM18P0DKX4 95 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF19P17023 458 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 CCNOP22674 350 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 HSD11B1P28845 292 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PSMB10P40306 273 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 OR5M11Q96RB7 305 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 FAM206AQ9NX38 181 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PLCE1Q9P212 2302 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 C5orf63A6NC05 138 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 E9PI62 339 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 MT-ND5P03915 603 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SLC2A1P11166 492 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PCMT1P22061 227 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PTAFRP25105 342 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TPTEP56180 551 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 WNT4P56705 351 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 BEX5Q5H9J7 111 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 XAF1Q6GPH4 301 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 DRAM2Q6UX65 266 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 RORBQ92753 470 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 C4orf45Q96LM5 186 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 MND1Q9BWT6 205 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 R4GMQ9 66 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ABCD4O14678 606 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SMPD2O60906 423 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 CRYAAP02489 173 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 LCKP06239 509 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TACSTD2P09758 323 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SLC6A9P48067 706 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 MMP16P51512 607 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 FDX2Q6P4F2 183 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 KLBQ86Z14 1044 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SVOPQ8N4V2 548 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 A0A087WXM4 84 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 CASKO14936 926 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGAE-202ENST00000570360 NGFP01138 241 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms