RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	SOX14	O95416	240 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ACSM4	P0C7M7	580 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF823	P16415	610 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TNFRSF1A	P19438	455 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	PYCR1	P32322	319 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	SLC25A1	P53007	311 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	MVK	Q03426	396 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	FLOT2	Q14254	428 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	AVPI1	Q5T686	147 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR51F2	Q8NH61	342 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	CCL17	Q92583	94 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	FEV	Q99581	238 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	IL19	Q9UHD0	177 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	SURF4	O15260	269 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	IFNG	P01579	166 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	MSMB	P08118	114 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ANPEP	P15144	967 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF3	P17036	446 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	FMO3	P31513	532 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ERF	P50548	548 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	CRMP1	Q14194	572 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	PCK2	Q16822	640 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	SPRN	Q5BIV9	151 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR8G5	Q8NG78	346 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	MAP6	Q96JE9	813 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	YY1AP1	Q9H869	796 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TVP23A	A6NH52	213 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784		F5H5K5	113 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	GNGT2	O14610	69 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	IGHV2-5	P01817	119 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	SELE	P16581	610 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	SPI1	P17947	270 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	GRK5	P34947	590 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ENTPD1	P49961	510 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	BLVRA	P53004	296 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TPTE	P56180	551 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TEX30	Q5JUR7	227 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR2T2	Q6IF00	324 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	SPATA24	Q86W54	205 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR5AS1	Q8N127	324 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	POMP	Q9Y244	141 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	NPTN	Q9Y639	398 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PKD1-231	ENST00000566784	STAB1	Q9NY15	2570 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1B0GWJ7	208 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784		H3BN98	237 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784		M0R135	149 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	LCAT	P04180	440 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	GYPB	P06028	91 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	BNIP1	Q12981	228 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF799	Q96GE5	643 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	OR2V2	Q96R30	315 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	WDR76	Q9H967	626 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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