RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560185.1

AKAP13-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 2

Gene AKAP13, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF878	C9JN71	531 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	EI24	O14681	340 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ALPL	P05186	524 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	LYN	P07948	512 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	INHBB	P09529	407 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ACSM4	P0C7M7	580 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RAC2	P15153	192 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC25A16	P16260	332 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SELE	P16581	610 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MPV17	P39210	176 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	DRAM2	Q6UX65	266 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	GID4	Q8IVV7	300 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SPRY3	O43610	288 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	LY6H	O94772	140 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TNFSF4	P23510	183 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	EPHA2	P29317	976 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ATP6V1E1	P36543	226 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	PSG7	Q13046	419 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RDH5	Q92781	318 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RFK	Q969G6	155 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SNTN	A6NMZ2	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SELENOF	O60613	162 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	PRKX	P51817	358 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	CCL8	P80075	99 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ST7L	Q8TDW4	575 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	DSCAM	O60469	2012 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ROS1	P08922	2347 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	CAD	P27708	2225 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	KITLG	P21583	273 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC2A5	P22732	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MMP15	P51511	669 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	EFNB1	P98172	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF786	Q8N393	782 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MNT	Q99583	582 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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