RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SGMS2Q8NHU3 365 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POM121L2Q96KW2 1035 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NMNAT3Q96T66 252 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDOQ99489 341 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WNT5BQ9H1J7 359 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CACNG2Q9Y698 323 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLSCR5A0PG75 271 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFNGP01579 166 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV1-46P01743 117 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLA-DQA2P01906 255 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LIPAP38571 399 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTR5AP47898 357 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MMP15P51511 669 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC3A1Q07837 685 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF774Q6NX45 483 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AMIGO2Q86SJ2 522 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LNX2Q8N448 690 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR52E2Q8NGJ4 325 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX47Q8TBZ9 253 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL17Q92583 94 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EGLN1Q9GZT9 426 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYSLTR2Q9NS75 346 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEK2Q9NYT0 353 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DYSFO75923 2080 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BSA7 217 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPRY3O43610 288 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOX14O95416 240 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WNT5AP41221 380 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAPP51397 102 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNMB1Q16558 191 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SDR9C7Q8NEX9 313 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2T33Q8NG76 320 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2T4Q8NH00 348 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR4Q3Q8NH05 313 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COG8Q96MW5 612 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C7orf69Q9H7B7 122 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLHL21Q9UJP4 597 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B9D1Q9UPM9 204 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WNK2Q9Y3S1 2297 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIIAD1A6NNX1 92 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABHD16AO95870 558 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADH4P08319 380 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EGR1P18146 543 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBG1P23258 451 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FPR2P25090 351 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MPV17P39210 176 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA46Q5T0L3 261 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BPIFB2Q8N4F0 458 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPEPL1Q8NDH3 523 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GJC3Q8NFK1 279 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABHD4Q8TB40 342 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C4orf45Q96LM5 186 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIRC2Q96SL1 478 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PKP2Q99959 881 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAL3ST1Q99999 423 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX12Q9BXU0 123 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 S100A14Q9HCY8 104 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBG2Q9NRH3 451 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATPIF1Q9UII2 106 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNG2Q9UJ96 466 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 G3V2T6 193 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BN98 237 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OSMP13725 252 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF823P16415 610 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADRA2CP18825 462 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR6V1Q8N148 313 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PARP8Q8N3A8 854 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSSK2Q96PF2 358 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC6A7Q99884 636 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OPN4Q9UHM6 478 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MGAM2Q2M2H8 2515 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPIAL4EA0A075B759 164 aa16.41■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa16.41■□□□□ 0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms