RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553287.5

ATXN3-217, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-217ENST00000553287 GMFGO60234 142 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 GOSR1O95249 250 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 GUCA1CO95843 209 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 APOC2P02655 101 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 OPN1LWP04000 364 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 GYPCP04921 128 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 HPNP05981 417 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 IL10P22301 178 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 PTPN6P29350 595 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 TTPAP49638 278 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 LHX2P50458 406 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 DIO3P55073 304 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 LIM2P55344 173 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 HERVK_113P63132 956 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ERVK-8P63133 956 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ACTG1P63261 375 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 VLDLRP98155 873 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ACVR1Q04771 509 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 RGS1Q08116 209 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 STX4Q12846 297 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 GGTLC2Q14390 218 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 HAGHQ16775 308 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 PARP6Q2NL67 630 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 PGGHGQ32M88 737 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CENPUQ71F23 418 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CEP112Q8N8E3 955 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 NT5CQ8TCD5 201 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SNF8Q96H20 258 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 C9orf85Q96MD7 179 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 GPR21Q99679 349 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 EHD1Q9H4M9 534 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 A0A1W2PP18 115 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 PSTPIP1O43586 416 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ZBTB14O43829 449 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 TGFAP01135 160 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CLPSP04118 112 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CPN1P15169 458 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 TBXA2RP21731 343 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 IL2RGP31785 369 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SAA4P35542 130 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 HSD17B2P37059 387 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 PTGDSP41222 190 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CASP3P42574 277 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SLC6A8P48029 635 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CLDN18P56856 261 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 RAB38P57729 211 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 RELAQ04206 551 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 BSPH1Q075Z2 132 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CDH17Q12864 832 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SNX1Q13596 522 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SCARB2Q14108 478 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SERTAD2Q14140 314 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CD226Q15762 336 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CARTPTQ16568 116 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 BEX5Q5H9J7 111 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 LIPNQ5VXI9 398 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SASS6Q6UVJ0 657 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 KATNAL2Q8IYT4 538 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 MORN4Q8NDC4 146 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CD200R1Q8TD46 325 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 S100PBPQ96BU1 408 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 ACTR6Q9GZN1 396 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 TREX1Q9NSU2 369 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 CHMP5Q9NZZ3 219 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 LRIT2A6NDA9 550 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-217ENST00000553287 DPRXA6NFQ7 191 aa3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms