RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 RAB8BQ92930 207 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 SARAFQ96BY9 339 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 FBXO17Q96EF6 278 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 DYNLL2Q96FJ2 89 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CMTM7Q96FZ5 175 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 TMEM80Q96HE8 168 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 ZNF488Q96MN9 340 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 TMEM56Q96MV1 263 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 PHB2Q99623 299 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 DHRS9Q9BPW9 319 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 DDA1Q9BW61 102 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CDCA4Q9BXL8 241 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 UGT2B28Q9BY64 529 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 KLK15Q9H2R5 256 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 OR51B5Q9H339 312 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 REEP1Q9H902 201 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CMTM6Q9NX76 183 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 FANCIQ9NVI1 1328 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 A0A1B0GVT2 93 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 EFCAB10A6NFE3 127 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 NME4O00746 187 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 RAD51CO43502 376 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 RAMP2O60895 175 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CTNSO60931 367 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 UGT2B11O75310 529 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 AQP8O94778 261 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 HPRT1P00492 218 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 IGHV4-59P01825 116 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 ARG1P05089 322 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 EDN1P05305 212 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CD55P08174 381 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 FCGR3AP08637 254 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 OR5AL1P0C617 328 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 OR9G9P0C7N8 305 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 HSD17B1P14061 328 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 RPS12P25398 132 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 GDF1P27539 372 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CRABP2P29373 138 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 RAB7AP51149 207 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 ACVR1Q04771 509 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 IL18R1Q13478 541 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 NFATC4Q14934 902 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 MS4A13Q5J8X5 152 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 HES5Q5TA89 166 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 TMEM179Q6ZVK1 233 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 C10orf107Q8IVU9 208 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 PIANPQ8IYJ0 282 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 PRR22Q8IZ63 422 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 ATPAF2Q8N5M1 289 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 C12orf29Q8N999 325 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 OR52B6Q8NGF0 335 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 OR10Z1Q8NGY1 313 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 OR4C3Q8NH37 302 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 C16orf78Q8WTQ4 265 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CRYGNQ8WXF5 182 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 TMEM234Q8WY98 164 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 FGF11Q92914 225 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 PAGE5Q96GU1 130 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 CEP170P1Q96L14 293 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 ATF6BQ99941 703 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 ZNF747Q9BV97 191 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 HCAR1Q9BXC0 346 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 PCBD2Q9H0N5 130 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 WDR13Q9H1Z4 485 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 RHOFQ9HBH0 211 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 INIPQ9NRY2 104 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 FAM206AQ9NX38 181 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 MMP17Q9ULZ9 603 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 GINS2Q9Y248 185 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 SNX10Q9Y5X0 201 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 NUP155O75694 1391 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-232ENST00000552331 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms