RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 UFD1Q92890 307 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF799Q96GE5 643 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 C4orf36Q96KX1 117 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MGLLQ99685 303 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 DOK1Q99704 481 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OPA3Q9H6K4 179 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CDH20Q9HBT6 801 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 LRP12Q9Y561 859 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TMEM212A6NML5 194 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 F5H5K5 113 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 H3BSA7 217 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OGG1O15527 345 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 XRCC2O43543 280 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PLPP2O43688 288 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ABHD16AO95870 558 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SERPINA3P01011 423 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ISG15P05161 165 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PLA2G2AP14555 144 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ATP6V1B1P15313 513 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 GALP22466 123 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SLC6A9P48067 706 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CX3CR1P49238 355 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CDH15P55291 814 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MALLQ13021 153 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TPBGQ13641 420 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RAB39AQ14964 217 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TIGD6Q17RP2 521 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TP53I3Q53FA7 332 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 KLBQ86Z14 1044 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FAM222BQ8WU58 562 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PHYHIPQ92561 330 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PELI1Q96FA3 418 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF75AQ96N20 296 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OR10A2Q9H208 303 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 BSNQ9UPA5 3926 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 A0A0U1RQV5 110 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 C5orf49A4QMS7 147 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CCRL2O00421 344 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ACSM4P0C7M7 580 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PATE4P0C8F1 98 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 HSMCR30P0CW71 290 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CPEP16870 476 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 KIR2DL3P43628 341 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TFF3Q07654 80 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CDK5R1Q15078 307 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TSC22D1Q15714 1073 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 NEDD8Q15843 81 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 BEX5Q5H9J7 111 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 XAF1Q6GPH4 301 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SPATC1Q76KD6 591 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SSX6Q7RTT6 188 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FTMTQ8N4E7 242 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 HTRA1Q92743 480 aa8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms