RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 TFAP2CQ92754 450 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 WNT2BQ93097 391 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FOXJ2Q9P0K8 574 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NEU3Q9UQ49 428 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SIRPB1O00241 398 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ACHEP22303 614 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MAVSQ7Z434 540 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PXKQ7Z7A4 578 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 Q8IYB0 196 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SNAPC3Q92966 411 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GPR12P47775 334 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TAS2R46P59540 309 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N402 240 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR51F2Q8NH61 342 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM106AQ96A25 262 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FGGYQ96C11 551 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 AHCYL1O43865 530 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CLDN14O95500 239 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 HLA-HP01893 362 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SSTR2P30874 369 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TAS2R31P59538 309 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CGB2Q6NT52 195 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MED30Q96HR3 178 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ABHD6Q9BV23 337 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SIAEQ9HAT2 523 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NOX4Q9NPH5 578 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PQM1 296 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ANGPTL7O43827 346 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MEF2DQ14814 521 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR4C3Q8NH37 302 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC35B4Q969S0 331 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GPR173Q9NS66 373 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CSF1P09603 554 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TBPP20226 339 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 HTR2CP28335 458 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CAMK2BQ13554 666 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SPARTQ8N0X7 666 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PHYHIPQ92561 330 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 REEP6Q96HR9 211 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SNX18Q96RF0 628 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RP1P56715 2156 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SSX4O60224 188 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RAB3DO95716 219 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 T-ENOLP0DO92 83 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CCL3P10147 92 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PPP1CBP62140 327 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC35B1P78383 322 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF691Q5VV52 312 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CREBBPQ92793 2442 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 K7ESF4 209 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SOCS6O14544 535 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 IMPA2O14732 288 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TSPAN4O14817 238 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 IFNA10P01566 189 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CD79BP40259 229 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GNG3P63215 75 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms