RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCK2	Q16822	640 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	HFE	Q30201	348 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC36A3	Q495N2	470 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL17	Q92583	94 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	FEV	Q99581	238 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR76	Q9H967	626 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHRS12	A0PJE2	317 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	MLNR	O43193	412 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	CST1	P01037	141 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFNA2	P01563	188 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSMB	P08118	114 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A1	P53007	311 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS12	P56730	875 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	GK3P	Q14409	553 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5AS1	Q8N127	324 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2T33	Q8NG76	320 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2T4	Q8NH00	348 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM186	Q96B77	213 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRGUK	Q96M69	825 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	COG8	Q96MW5	612 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PITX2	Q99697	317 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATF6B	Q99941	703 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	POMP	Q9Y244	141 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014		F5H5K5	113 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0YL77	283 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	AVP	P01185	164 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-DQA2	P01906	255 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPI1	P17947	270 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHC2	Q8IXK0	858 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8G5	Q8NG78	346 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	GIPC3	Q8TF64	312 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED20	Q9H944	212 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	NTN4	Q9HB63	628 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM183A	A6NL82	134 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	GYG2	O15488	501 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSC2	O15499	205 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLPP2	O43688	288 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF823	P16415	610 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	BNIP1	Q12981	228 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ECH1	Q13011	328 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	FLOT2	Q14254	428 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST7L	Q8TDW4	575 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB1C	Q92928	201 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.71	□□□□□ -0.69

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