RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF83P51522 516 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35A2P78381 396 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SCRN3Q0VDG4 424 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 AGAP6Q5VW22 663 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SKA3Q8IX90 412 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 OR52N5Q8NH56 324 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 OTOSQ8NHW6 89 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 JAM3Q9BX67 310 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SLC17A5Q9NRA2 495 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 USF3Q68DE3 2245 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PR80 420 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 J3QRE1 110 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CD5LO43866 347 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 PTHP01270 115 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 IGHA1P01876 353 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CD79AP11912 226 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 PLP2Q04941 152 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 RNLSQ5VYX0 342 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SLC22A25Q6T423 547 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 DTX2Q86UW9 622 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SNX33Q8WV41 574 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 HTRA1Q92743 480 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO17Q96EF6 278 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 TBX5Q99593 518 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ABHD6Q9BV23 337 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 VPS13CQ709C8 3753 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ROS1P08922 2347 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 A0A087WXM4 84 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 M0R1B8 84 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SGCEO43556 437 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 HLA-HP01893 362 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 TACSTD2P09758 323 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF32P17041 273 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 HCCSP53701 268 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ACTA2P62736 377 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 RAB1AP62820 205 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ACTG2P63267 376 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 HIST1H3AP68431 136 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 EGR3Q06889 387 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 PIGFQ07326 219 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SPOCK1Q08629 439 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ECH1Q13011 328 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 GALEQ14376 348 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 TAF13Q15543 124 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 GSG1Q2KHT4 349 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 OTPQ5XKR4 325 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CORO6Q6QEF8 472 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 DEGS2Q6QHC5 323 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 KRT77Q7Z794 578 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 SVOPQ8N4V2 548 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 RADILQ96JH8 1075 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 MROQ9BYG7 248 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 OR2H1Q9GZK4 316 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CENPMQ9NSP4 180 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms