RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505583.5

GYPB-205, Transcript of glycophorin B (MNS blood group), human

TSL 1 (best)

Gene GYPB, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYPB-205	ENST00000505583	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	OAF	Q86UD1	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	SYT4	Q9H2B2	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	RERGL	Q9H628	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	SOCS2	O14508	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	SLC16A7	O60669	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PTP4A3	O75365	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	KRT34	O76011	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	MELTF	P08582	738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	NR2C1	P13056	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	TUBG1	P23258	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PSMB10	P40306	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	MTNR1A	P48039	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PITPNB	P48739	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	RAG2	P55895	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	AQP6	Q13520	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	TRAM2	Q15035	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	MPPED2	Q15777	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	ARL9	Q6T311	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583		Q6YL49	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	CITED1	Q99966	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GYPB-205	ENST00000505583	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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