RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 PIAS2O75928 621 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ADRA2CP18825 462 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 THBS2P35442 1172 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 OR10G3Q8NGC4 313 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PPA2Q9H2U2 334 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PRR13Q9NZ81 148 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNAB3O43448 404 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PNPP00491 289 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GUSBP08236 651 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP2K6P52564 334 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 MTCP1P56278 107 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 HERV-K104P61576 105 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PMS2P2O95744 297 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ACSM4P0C7M7 580 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SYT13Q7L8C5 426 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GALNT16Q8N428 558 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GNRHR2Q96P88 292 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 KLHDC3Q9BQ90 382 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB22AQ9UL26 194 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 R4GMQ9 66 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 P04436 131 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 LAP3P28838 519 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 OPRM1P35372 400 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 LTBRP36941 435 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PLGLB1Q02325 96 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PIGCQ92535 297 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PBOV1Q9GZY1 135 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0G2JK05 382 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 A6NCN8 305 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 JMJD7P0C870 316 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC51BQ86UW2 128 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 B8ZZF3 427 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ALG1L2C9J202 215 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 TOR1AO14656 332 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 MBTPS2O43462 519 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 LMX1BO60663 402 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 POU2F2P09086 479 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 NR2C1P13056 603 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 EPHA4P54764 986 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 MYBPHQ13203 477 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PDCD1Q15116 288 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF128Q8TEB7 428 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 BORCS8Q96FH0 119 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CXorf58Q96LI9 332 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 MESP1Q9BRJ9 268 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GAREM1Q9H706 876 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 DOCK7Q96N67 2140 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 BPTFQ12830 3046 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GBF1Q92538 1859 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 C7orf66A4D0T2 115 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 LILRA5A6NI73 299 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GLB1P16278 677 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 RFC3P40938 356 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CX3CR1P49238 355 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GUSBP11Q6P575 273 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC20BQ86Y33 519 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 TMED6Q8WW62 240 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CHRDQ9H2X0 955 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF254O75437 659 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 TGM6O95932 706 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SPINK2P20155 84 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 BCKDHBP21953 392 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 GLP1RP43220 463 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 PRR18Q8N4B5 295 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms