RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 PLA2G7Q13093 441 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ST8SIA1Q92185 356 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PIGCQ92535 297 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 MENTQ9BUN1 341 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF576Q9H609 170 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 GAREM1Q9H706 876 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 GJE1A6NN92 205 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 NGFRP08138 427 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 JMJD7P0C870 316 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 GLI4P10075 376 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 MGMTP16455 207 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 LAP3P28838 519 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PPT1P50897 306 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FOXF1Q12946 379 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 RIN1Q13671 783 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 Q5BKY6 102 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 IL32P24001 234 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PIGMQ9H3S5 423 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SLC5A6Q9Y289 635 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 C4orf47A7E2U8 309 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 LMO7DNF2Z398 122 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SSX5O60225 188 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 WNT11O96014 354 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 DHRS2Q13268 280 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 C11orf40Q8WZ69 217 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 METTL9Q9H1A3 318 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.93□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 RTTNQ86VV8 2226 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SYNGR4O95473 234 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 NR0B2Q15466 257 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 LYG2Q86SG7 212 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 NTMQ9P121 344 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PLXNA3P51805 1871 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 C2CD4DB7Z1M9 353 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 KLF4O43474 513 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CDC20BQ86Y33 519 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CA10Q9NS85 328 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM74BQ9NUR3 256 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ALG1L2C9J202 215 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FOXS1O43638 330 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SIGLEC6O43699 453 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CDAP32320 146 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 HTR5AP47898 357 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FUT7Q11130 342 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF695Q8IW36 515 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ZFP57Q9NU63 452 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 C1orf123Q9NWV4 160 aa11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 DCTN6O00399 190 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 RRASP10301 218 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CPN1P15169 458 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 MSX1P28360 303 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 HOXC12P31275 282 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 EFNB2P52799 333 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 GJC3Q8NFK1 279 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 NME1P15531 152 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 THBS2P35442 1172 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 MALLQ13021 153 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 THEM4Q5T1C6 240 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 MOB3CQ70IA8 216 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 EXD3Q8N9H8 876 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms