RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493849.5

NDUFS2-213, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2, human

TSL 3

Gene NDUFS2, Length 910 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS2-213	ENST00000493849	BCAP31	P51572	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PROK1	P58294	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CDK6	Q00534	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	BAMBI	Q13145	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TAB1	Q15750	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	NRF1	Q16656	503 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	AGK	Q53H12	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FOXC2	Q99958	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PKIB	Q9C010	78 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CR1	P17927	2039 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849		A0A1B0GWA3	101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	SULT2B1	O00204	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TOR1A	O14656	332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	SLC22A2	O15244	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CLPX	O76031	633 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	OPN1SW	P03999	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	THY1	P04216	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	LIPF	P07098	398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CHRM2	P08172	466 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ITGA5	P08648	1049 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CD99	P14209	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	UQCRB	P14927	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PPP3CB	P16298	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CD40LG	P29965	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CDKN1B	P46527	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CAPZA2	P47755	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	CTBP2	P56545	445 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PRPS1	P60891	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	HOXC5	Q00444	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PIGF	Q07326	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	SCN1B	Q07699	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	RBBP4	Q09028	425 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	P2RY6	Q15077	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849		Q6ZT83	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NDUFS2-213	ENST00000493849		Q8NFD4	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms