RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.46□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 CD300AQ9UGN4 299 aa7.46□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.46□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.46□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.46□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1B0GW55 424 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM89A2RUT3 159 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 KCNAB3O43448 404 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 OR10H3O60404 316 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 SNX3O60493 162 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 SOX14O95416 240 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 TXNDC12O95881 172 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 WNT2P09544 360 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ACSM4P0C7M7 580 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 COX5BP10606 129 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GSTM3P21266 225 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 OMGP23515 440 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 NOS3P29474 1203 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DLX1P56177 255 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 PAX2Q02962 417 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 KCNMB1Q16558 191 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 MOGQ16653 247 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 AWAT1Q58HT5 328 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 OR8G5Q8NG78 346 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 NANPQ8TBE9 248 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 PTP4A1Q93096 173 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 MED20Q9H944 212 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 CTSZQ9UBR2 303 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DUX4Q9UBX2 424 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 IL19Q9UHD0 177 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.45□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GMNCA6NCL1 334 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 C22orf46C9J442 243 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 WIPF1O43516 503 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 FAM20BO75063 409 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GASTP01350 101 aa7.44□□□□□ -1.22
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HDAC3-211ENST00000491581 LCATP04180 440 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 SFTPBP07988 381 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 NR2C1P13056 603 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ANPEPP15144 967 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF12P17014 697 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 PCMT1P22061 227 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 CA6P23280 308 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GSSP48637 474 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 RPS6KA3P51812 740 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF92Q03936 586 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 COX10Q12887 443 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00471Q8N535 108 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 C3orf56Q8N813 242 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF511Q8NB15 262 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 FNDC8Q8TC99 324 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 SEH1LQ96EE3 360 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 AMELYQ99218 206 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 DDOQ99489 341 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 PITX2Q99697 317 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 GORASP2Q9H8Y8 452 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC3-211ENST00000491581 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.44□□□□□ -1.22
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