RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491339.1

GABRE-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 2

Gene GABRE, Length 2,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-211ENST00000491339 AVPI1Q5T686 147 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 C1orf159Q96HA4 380 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 GPA33Q99795 319 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 GAL3ST1Q99999 423 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SOX7Q9BT81 388 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 DYSFO75923 2080 aa7.38□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 RER1O15258 196 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 MPZL1O95297 269 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 BAG2O95816 211 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 CD55P08174 381 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ZNF823P16415 610 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 KITLGP21583 273 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 THBS2P35442 1172 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 COX10Q12887 443 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ECH1Q13011 328 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 RCN1Q15293 331 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 OR2T4Q8NH00 348 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 CCL17Q92583 94 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 TMEM186Q96B77 213 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 TSSK2Q96PF2 358 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ATF6BQ99941 703 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 FN3KQ9H479 309 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 B9D1Q9UPM9 204 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ATRQ13535 2644 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 IFNGP01579 166 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 RAC2P15153 192 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SELEP16581 610 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 VHLP40337 213 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 MEP1BQ16820 701 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 MICAQ29983 383 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 OR6V1Q8N148 313 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 OR2T33Q8NG76 320 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 NRBF2Q96F24 287 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PITX2Q99697 317 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PKP2Q99959 881 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 NTN4Q9HB63 628 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 MSL2Q9HCI7 577 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 TREM2Q9NZC2 230 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.37□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 G3V2T6 193 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 DCTN6O00399 190 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 GPANK1O95872 356 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ZNF3P17036 446 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 MALLQ13021 153 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PSG7Q13046 419 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 OTPQ5XKR4 325 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SPICQ8N5J4 248 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 ST7LQ8TDW4 575 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SLC7A6Q92536 515 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 PTP4A1Q93096 173 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 SPTSSAQ969W0 71 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 CMBLQ96DG6 245 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 MDFIQ99750 246 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 VNN3Q9NY84 501 aa7.36□□□□□ -1.23
GABRE-211ENST00000491339 A0A0G2JMP0 313 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms