RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB5O15062 677 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SRMP19623 302 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 UCNP55089 124 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RCAN2Q14206 197 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 Q6P435 159 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ULK3Q6PHR2 472 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 WDR82Q6UXN9 313 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TIFABQ6ZNK6 161 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf56Q8N910 161 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 OR51F2Q8NH61 342 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MED4Q9NPJ6 270 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MTFP1Q9UDX5 166 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GVX0 72 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 NME4O00746 187 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SIVA1O15304 175 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA3DO95025 777 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 OTCP00480 354 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PGAM1P18669 254 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RAB5AP20339 215 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TUBG1P23258 451 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SSTR5P35346 364 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RAB7AP51149 207 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RPS23P62266 143 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TFDP2Q14188 446 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 UNC93AQ86WB7 457 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PGAM4Q8N0Y7 254 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 COX18Q8N8Q8 333 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 OR5W2Q8NH69 310 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PIFOQ8TCI5 191 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 BTN2A3PQ96KV6 586 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 FOPNLQ96NB1 174 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM17AQ99595 171 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TUBG2Q9NRH3 451 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 HYOU1Q9Y4L1 999 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 NACAE9PAV3 2078 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SNAI2O43623 268 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SCELO95171 688 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 CTSLP07711 333 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TACSTD2P09758 323 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 DTYMKP23919 212 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 FABP6P51161 128 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SYNJ2BPP57105 145 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TCEAL5Q5H9L2 206 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 AVPI1Q5T686 147 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RAB1CQ92928 201 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TCEAL3Q969E4 200 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 VCXQ9H320 206 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 GABRR3A8MPY1 467 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ERI3O43414 337 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ENTPD5O75356 428 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 GFAPP14136 432 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MAGP20916 626 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MYL9P24844 172 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PFN2P35080 140 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RBM34P42696 430 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 DGCR6Q14129 220 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF266Q14584 549 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ISOC2Q96AB3 205 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 PDXPQ96GD0 296 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RNF145Q96MT1 663 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 KLK12Q9UKR0 248 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MROH5Q6ZUA9 1318 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ERCC6Q03468 1493 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 H7C1H1 209 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 MED6O75586 246 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 TDP2O95551 362 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF823P16415 610 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 RGS19P49795 217 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN2DP55273 166 aa4.86□□□□□ -1.63
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