RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-215ENST00000490753 SNAPC1Q16533 368 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CTF1Q16619 201 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 RGS21Q2M5E4 152 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TRIM16LQ309B1 348 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 KLHL22Q53GT1 634 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CARD17Q5XLA6 110 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 C12orf73Q69YU5 71 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 NDNFQ8TB73 568 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 FNDC8Q8TC99 324 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 LGALS12Q96DT0 336 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CEP19Q96LK0 163 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 DUX5Q96PT3 197 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ARHGDIGQ99819 225 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 SELENONQ9NZV5 590 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.25□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 C17orf100A8MU93 164 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 J3QRK9 145 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CCRL2O00421 344 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ENTPD6O75354 484 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 OR5F1O95221 314 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 GABRB1P18505 474 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 GADD45AP24522 165 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 GRPRP30550 384 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 GIPRP48546 466 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CCL8P80075 99 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 HOXC5Q00444 222 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 OCLNQ16625 522 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ZNF627Q7L945 461 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 RFKQ969G6 155 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 FOXB1Q99853 325 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 EMC6Q9BV81 110 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CACNG2Q9Y698 323 aa8.24□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 E9PQ18 207 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 UBL3O95164 117 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TSPAN19P0C672 248 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 FAM157BP0CG42 384 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 HLA-DOBP13765 273 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 GATA3P23771 443 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 PRTN3P24158 256 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 FPR2P25090 351 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ATP6V1E1P36543 226 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TGFBR2P37173 567 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 LIPAP38571 399 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 OPRL1P41146 370 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 RANBP1P43487 201 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 BMXP51813 675 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ERVS71-1P61550 626 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 RAB1AP62820 205 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ZNF91Q05481 1191 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 TSPAN31Q12999 210 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 ZNF404Q494X3 552 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 DOK3Q7L591 496 aa8.23□□□□□ -1.09
NOP56-215ENST00000490753 UEVLDQ8IX04 471 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms