RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CENPMQ9NSP4 180 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 BABAM2Q9NXR7 383 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 IKZF2Q9UKS7 526 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 COPS3Q9UNS2 423 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 NKX2-6A6NCS4 301 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ICMTO60725 284 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CRYGSP22914 178 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 PTAFRP25105 342 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 STOMP27105 288 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CCKARP32238 428 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 HTR5AP47898 357 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 TGM4P49221 684 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 GDI2P50395 445 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 MMP16P51512 607 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 HCCSP53701 268 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 PIGFQ07326 219 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 GPR50Q13585 617 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SPHARQ15513 63 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 TAB1Q15750 504 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D28Q2M2D7 210 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 UBE2UQ5VVX9 321 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CORO6Q6QEF8 472 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 TMEM108Q6UXF1 575 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ZNF367Q7RTV3 350 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 OR10S1Q8NGN2 331 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 FGFBP3Q8TAT2 258 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 C14orf79Q96F83 325 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 MED18Q9BUE0 208 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 TRIM36Q9NQ86 728 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ZNF391Q9UJN7 358 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 LRP12Q9Y561 859 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 TUBAL3A6NHL2 446 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 J3QLW9 94 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ABHD16AO95870 558 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CD1AP06126 327 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 HTR1AP08908 422 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 PSKH1P11801 424 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ZNF19P17023 458 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CD53P19397 219 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 PCSK6P29122 969 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 RPS27P42677 84 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CCR9P51686 369 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 TSC22D1Q15714 1073 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 LIPNQ5VXI9 398 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ZNF774Q6NX45 483 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 LRRN1Q6UXK5 716 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 AKR7LQ8NHP1 331 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 HTRA1Q92743 480 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 RORBQ92753 470 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 RADILQ96JH8 1075 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 POM121L2Q96KW2 1035 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 C4orf36Q96KX1 117 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 AMELYQ99218 206 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ACOT13Q9NPJ3 140 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SCOCQ9UIL1 159 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 GNG8Q9UK08 70 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SPEF1Q9Y4P9 236 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CACNA1CQ13936 2221 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ALPK2Q86TB3 2170 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 M0R135 149 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CASKO14936 926 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CLPTM1O96005 669 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 PATE4P0C8F1 98 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 PCMT1P22061 227 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ART1P52961 327 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 NR1H2P55055 460 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 OR12D2P58182 307 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 RAB39AQ14964 217 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SSX6Q7RTT6 188 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 FAM222BQ8WU58 562 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 PELI1Q96FA3 418 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 ZNF799Q96GE5 643 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-211ENST00000488243 DOK1Q99704 481 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms