RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 INHBAP08476 426 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 IL3P08700 152 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZNF250P15622 560 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 IVDP26440 423 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SERPINB1P30740 379 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ARL3P36405 182 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ARR3P36575 388 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 MPV17P39210 176 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CAPZA2P47755 286 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GALK2Q01415 458 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 MERTKQ12866 999 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 DUSP5Q16690 384 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 KLHL26Q53HC5 615 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TEX35Q5T0J7 233 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 STEAP4Q687X5 459 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CCDC190Q86UF4 302 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR2L13Q8N349 312 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CCDC89Q8N998 374 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 L3MBTL4Q8NA19 623 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 RORBQ92753 470 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TMEM45BQ96B21 275 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ERP27Q96DN0 273 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 MUC13Q9H3R2 512 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZNF702PQ9H963 129 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 A0A1W2PQD3 144 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TMEM178BH3BS89 294 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 K7EPI3 171 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 UBXN8O00124 270 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PCDH7O60245 1069 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 FCMRO60667 390 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 FCN3O75636 299 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SEMA3DO95025 777 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 AKR7A3O95154 331 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SCGB1D1O95968 90 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PTMAP06454 111 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CD79AP11912 226 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 UQCRC2P22695 453 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 MMP15P51511 669 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 P2RY4P51582 365 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CCR4P51679 360 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 BPIFB3P59826 476 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 BTG1P62324 171 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PSPHP78330 225 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CRYMQ14894 314 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 MED22Q15528 200 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TTMPQ5BVD1 217 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 LRIF1Q5T3J3 769 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 NIPAL3Q6P499 406 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 Q75L30 129 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PXKQ7Z7A4 578 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 VSTM4Q8IW00 320 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZNF101Q8IZC7 436 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 KDM8Q8N371 416 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SPICQ8N5J4 248 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR5W2Q8NH69 310 aa3.42□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms