RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486028.1

HMG20B-211, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 2

Gene HMG20B, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-211ENST00000486028 SNAPC1Q16533 368 aa10.66□□□□□ -0.7
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HMG20B-211ENST00000486028 CIB1Q99828 191 aa10.64□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.64□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 CENPMQ9NSP4 180 aa10.64□□□□□ -0.71
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HMG20B-211ENST00000486028 SLC15A1P46059 708 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 RPS7P62081 194 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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HMG20B-211ENST00000486028 PPP2R2BQ00005 443 aa10.63□□□□□ -0.71
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HMG20B-211ENST00000486028 MED21Q13503 144 aa10.63□□□□□ -0.71
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HMG20B-211ENST00000486028 ZMAT1Q5H9K5 638 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 CLEC9AQ6UXN8 241 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 COLCA1Q6ZS62 124 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 TIGD4Q8IY51 512 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 OR10S1Q8NGN2 331 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 OR6N2Q8NGY6 317 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 CMBLQ96DG6 245 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 SLAMF6Q96DU3 332 aa10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
HMG20B-211ENST00000486028 COPS4Q9BT78 406 aa10.63□□□□□ -0.71
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