RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	COQ7	Q99807	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792		U3KQV3	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RER1	O15258	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SURF4	O15260	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SHOX	O15266	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SGCE	O43556	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SSX4	O60224	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	STAMBP	O95630	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	FSTL3	O95633	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	LY6G6D	O95868	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	REN	P00797	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SLC25A16	P16260	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SPI1	P17947	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PRKACG	P22612	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CAPZA2	P47755	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ESRRG	P62508	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	TEK	Q02763	1124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ECH1	Q13011	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PSG7	Q13046	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CRMP1	Q14194	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	MED20	Q9H944	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PPL8	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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