RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 CD55P08174 381 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 TNFRSF1AP19438 455 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 MPV17P39210 176 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CRISP1P54107 249 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CCL8P80075 99 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 PSG7Q13046 419 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 GGTLC2Q14390 218 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 TAF13Q15543 124 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 HFEQ30201 348 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CYB5R2Q6BCY4 276 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 LINC00346Q8IVM7 164 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CMBLQ96DG6 245 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 INTS14Q96SY0 518 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 TOR3AQ9H497 397 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 MARCH7Q9H992 704 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 KRT84Q9NSB2 600 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 TMEM160Q9NX00 188 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 A8MV72 311 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ZNF878C9JN71 531 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 F5H5K5 113 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 IFNL4K9M1U5 179 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 M0R135 149 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 IGHV1-46P01743 117 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 SPARCP09486 303 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ACSM4P0C7M7 580 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 GSTT1P30711 240 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ACTR3P61158 418 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CDK5R2Q13319 367 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CCNIQ14094 377 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ACSM5Q6NUN0 579 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 HS3ST5Q8IZT8 346 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 SLC7A6Q92536 515 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 OTULINQ96BN8 352 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ZNF799Q96GE5 643 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 TIMD4Q96H15 378 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 MAP6Q96JE9 813 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 KCNJ15Q99712 375 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 SLC22A4Q9H015 551 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 IL19Q9UHD0 177 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ABCA1O95477 2261 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 TVP23AA6NH52 213 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CLDN25C9JDP6 229 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 LCATP04180 440 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 GYPBP06028 91 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 DBHP09172 617 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 MAGEB1P43366 347 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ERFP50548 548 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 DAPP51397 102 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 SNAPC1Q16533 368 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 LINC01590Q5TEZ4 76 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 PLBD1Q6P4A8 553 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 IQCF1Q8N6M8 205 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ZNF511Q8NB15 262 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 OR8G5Q8NG78 346 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 RAB1CQ92928 201 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ITFG2Q969R8 447 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 COPS4Q9BT78 406 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 WDR76Q9H967 626 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 FAM183AA6NL82 134 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 IQCF6A8MYZ5 107 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 INAFM1C9JVW0 142 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 SPRY3O43610 288 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 LILRA1O75019 489 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 RP2O75695 350 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 NCR1O76036 304 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 ANPEPP15144 967 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 PCMT1P22061 227 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 CFL1P23528 166 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 COL8A2P25067 703 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 SLC6A9P48067 706 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-211ENST00000476336 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms