RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 DCKP27707 260 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 HCAR3P49019 387 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 VPS26BQ4G0F5 336 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 MPV17L2Q567V2 206 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 AVPI1Q5T686 147 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 GPR151Q8TDV0 419 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 STARD10Q9Y365 291 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 UNC13BO14795 1591 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 MLH3Q9UHC1 1453 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 MAP3K1Q13233 1512 aa3.15□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 IGKV1D-16P01601 117 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 RAB3AP20336 220 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 SPATA4Q8NEY3 305 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 NT5C3BQ969T7 300 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 SLC29A1Q99808 456 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PISDQ9UG56 409 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ATRNO75882 1429 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TIAM1Q13009 1591 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 RALGAPBQ86X10 1494 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 DIP2AQ14689 1571 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PCNTO95613 3336 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 RAB29O14966 203 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ZNF688P0C7X2 276 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 IL1RNP18510 177 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 P2RX1P51575 399 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 CCNG1P51959 295 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TAS2R31P59538 309 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 CRADDP78560 199 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 CDK5Q00535 292 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 OR7A5Q15622 319 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 SASS6Q6UVJ0 657 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 KIFAP3Q92845 792 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 C1orf198Q9H425 327 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TMEM9BQ9NQ34 198 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 NLRP1Q9C000 1473 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ABCC3O15438 1527 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP5Q13017 1502 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PALMO75781 387 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ACSM4P0C7M7 580 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 GGT1P19440 569 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ZNF726P1Q15940 193 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PRELID2Q8N945 189 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 MICU1Q9BPX6 476 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 MIA2Q96PC5 1412 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 SETD5Q9C0A6 1442 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 VGLL3A8MV65 326 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 CHST10O43529 356 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 CBR3O75828 277 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ANXA5P08758 320 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 TNNI1P19237 187 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 ME2P23368 584 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PPP1CBP62140 327 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 GPR107Q5VW38 600 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 SHANK3Q9BYB0 1731 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 A2MP01023 1474 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 KLHL41O60662 606 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-210ENST00000472326 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
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