RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455953.1

NCBP2-208, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 5

Gene NCBP2, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-208	ENST00000455953	OR6C6	A6NF89	314 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953		H7C1C5	153 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC16A7	O60669	478 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV1-46	P01743	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	THY1	P04216	161 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SBK2	P0C263	348 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	COX5B	P10606	129 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF823	P16415	610 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	RHCE	P18577	417 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SDHA	P31040	664 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	RRM2	P31350	389 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC6A6	P31641	620 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	MNAT1	P51948	309 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ERVS71-1	P61550	626 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	LCN6	P62502	163 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	PSG4	Q00888	419 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SPIB	Q01892	262 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	MZT1	Q08AG7	82 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	TAF13	Q15543	124 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	KCNJ8	Q15842	424 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF774	Q6NX45	483 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	FANK1	Q8TC84	345 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	YIPF5	Q969M3	257 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	RASD2	Q96D21	266 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF75A	Q96N20	296 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM107B	Q9H098	131 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	MSL2	Q9HCI7	577 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	POLE4	Q9NR33	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	NPTN	Q9Y639	398 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	PRSS37	A4D1T9	235 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	UNC119B	A6NIH7	251 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM157A	C9JC47	383 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953		J3KTA2	159 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	FXYD1	O00168	92 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	PLPP2	O43688	288 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	OR10H3	O60404	316 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	NCR1	O76036	304 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	GADD45G	O95257	159 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	LYPD3	O95274	346 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC6A9	P48067	706 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	GZMM	P51124	257 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	BTG1	P62324	171 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	LCN2	P80188	198 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	RUNX1T1	Q06455	604 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ECH1	Q13011	328 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	GLYAT	Q6IB77	296 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	C16orf89	Q6UX73	402 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	PTP4A1	Q93096	173 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SPTSSA	Q969W0	71 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	CMBL	Q96DG6	245 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SEPHS2	Q99611	448 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	PITX2	Q99697	317 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SOX7	Q9BT81	388 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	IFT27	Q9BW83	186 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	SYT4	Q9H2B2	425 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	EMC7	Q9NPA0	242 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	IL19	Q9UHD0	177 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953		V9GYQ6	96 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A1W2PRQ8	180 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NCBP2-208	ENST00000455953	RP2	O75695	350 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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