RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 DDOQ99489 341 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 PITX2Q99697 317 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 GAL3ST1Q99999 423 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 REEP1Q9H902 201 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 IL20Q9NYY1 176 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 C5orf63A6NC05 138 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ACOT8O14734 319 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 PLPP2O43688 288 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 IDH3BO43837 385 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 AVPP01185 164 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ACSM4P0C7M7 580 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 CLUP10909 449 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SELEP16581 610 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 RGS6P49758 472 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 MICAQ29983 383 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ADGRG5Q8IZF4 528 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 IQCF1Q8N6M8 205 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 OR10G2Q8NGC3 310 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 CANT1Q8WVQ1 401 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 RAB1CQ92928 201 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 OR2V2Q96R30 315 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 DIRC2Q96SL1 478 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ATF6BQ99941 703 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 MLNRO43193 412 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 CST1P01037 141 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 RAP2AP10114 183 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 RAC2P15153 192 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ZNF823P16415 610 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SLC36A3Q495N2 470 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 HS3ST5Q8IZT8 346 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 LNX2Q8N448 690 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 LINC00471Q8N535 108 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ZNF511Q8NB15 262 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 RAB39BQ96DA2 213 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SIGLEC11Q96RL6 698 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 CHID1Q9BWS9 393 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 HCAR1Q9BXC0 346 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 DGCR6LQ9BY27 220 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 C1orf21Q9H246 121 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 MED20Q9H944 212 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 NPTNQ9Y639 398 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 LOC105371242A0A075B767 164 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 F5H5P2 479 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ZNF205O95201 554 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 IGHV2-70P01814 119 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 LCATP04180 440 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DPB1P04440 258 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SPARCP09486 303 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SBK2P0C263 348 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SPI1P17947 270 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TUBG1P23258 451 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TNFSF4P23510 183 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 LCN2P80188 198 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ACSM5Q6NUN0 579 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SPATC1Q76KD6 591 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ZNF283Q8N7M2 679 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 OR8G5Q8NG78 346 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 OR2T4Q8NH00 348 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 OR2AE1Q8NHA4 323 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 COG8Q96MW5 612 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 FEVQ99581 238 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 IL19Q9UHD0 177 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TRAV20A0A0B4J274 112 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 DHRS12A0PJE2 317 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 FAM183AA6NL82 134 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 IQCF6A8MYZ5 107 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 J3QW42 95 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 M0R135 149 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 PNPP00491 289 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms