RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 GP6Q9HCN6 339 aa8.68□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 B9D1Q9UPM9 204 aa8.68□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.68□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.68□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 GPR171O14626 319 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SELENOFO60613 162 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SLC16A7O60669 478 aa8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 LIMS4P0CW20 117 aa8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 NR2C1P13056 603 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 DCKP27707 260 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 CRABP1P29762 137 aa8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 CLRN1P58418 232 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SYT14Q8NB59 555 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 MUL1Q969V5 352 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 RADILQ96JH8 1075 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 GLRX2Q9NS18 164 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 EMC3Q9P0I2 261 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.67□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 ZNF726A6NNF4 738 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 PIN1P1O15428 100 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SLC43A1O75387 559 aa8.66□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 TACSTD2P09758 323 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 ACTA1P68133 377 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF85Q03923 595 aa8.66□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.66□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.66□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 ZNF544Q6NX49 715 aa8.66□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 HPS1Q92902 700 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 MCHR2Q969V1 340 aa8.66□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 GLTPQ9NZD2 209 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 PRSS50Q9UI38 385 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 COPS3Q9UNS2 423 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 COL7A1Q02388 2944 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 TVP23AA6NH52 213 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 PRR32B1ATL7 298 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 UPK3AO75631 287 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 LCKP06239 509 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 YES1P07947 543 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 MYL12AP19105 171 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 CD40P25942 277 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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