RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 FSHBP01225 129 aa22.91■■□□□ 1.26
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LMO1-202ENST00000428101 MMP16P51512 607 aa22.91■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 HMGA2P52926 109 aa22.91■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 SPATS1Q496A3 300 aa22.91■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.91■■□□□ 1.26
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LMO1-202ENST00000428101 OR52E2Q8NGJ4 325 aa22.91■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 OR13G1Q8NGZ3 307 aa22.91■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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LMO1-202ENST00000428101 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa22.91■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 IQCF6A8MYZ5 107 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 H0YL77 283 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 ACSM4P0C7M7 580 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 SLC6A9P48067 706 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 SLC27A4Q6P1M0 643 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 MEGF10Q96KG7 1140 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 DDOQ99489 341 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 PITX2Q99697 317 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 SLC30A2Q9BRI3 323 aa22.9■■□□□ 1.26
LMO1-202ENST00000428101 EGLN3Q9H6Z9 239 aa22.9■■□□□ 1.26
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LMO1-202ENST00000428101 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 MLNRO43193 412 aa22.89■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 DCTN3O75935 186 aa22.89■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 KRT36O76013 467 aa22.89■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa22.89■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 NAA40Q86UY6 237 aa22.89■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 DEFB108BQ8NET1 73 aa22.89■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.89■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 F5H5K5 113 aa22.88■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 ATP6V1B2P21281 511 aa22.88■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 MDH2P40926 338 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 TENM1Q9UKZ4 2725 aa22.87■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 OR4C15Q8NGM1 316 aa22.87■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 ZNRF4Q8WWF5 429 aa22.87■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 MAP6Q96JE9 813 aa22.87■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa22.87■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 ACTR3BQ9P1U1 418 aa22.87■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 CDH10Q9Y6N8 788 aa22.87■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 A8MXK9 166 aa22.86■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 F5H5P2 479 aa22.86■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 CYB561A3Q8NBI2 242 aa22.86■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 FAM216AQ8WUB2 273 aa22.86■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 HCAR1Q9BXC0 346 aa22.86■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 TMEM100Q9NV29 134 aa22.86■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 IL20Q9NYY1 176 aa22.86■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa22.86■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa22.85■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 TCRBV5S2A0A599 114 aa22.85■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 ZNF205O95201 554 aa22.85■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 GASTP01350 101 aa22.85■■□□□ 1.25
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LMO1-202ENST00000428101 ZNF154Q13106 437 aa22.85■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa22.85■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 C12orf54Q6X4T0 127 aa22.85■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 OR52L1Q8NGH7 329 aa22.85■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 OR8D4Q8NGM9 314 aa22.85■■□□□ 1.25
LMO1-202ENST00000428101 OR10S1Q8NGN2 331 aa22.85■■□□□ 1.25
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