RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF45Q02386 682 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 WDR38Q5JTN6 314 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZSR3 168 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 LINGO2Q7L985 606 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CDH26Q8IXH8 852 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DERL3Q96Q80 235 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 NEK6Q9HC98 313 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 HMG20AQ9NP66 347 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 FAM206AQ9NX38 181 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CKLFQ9UBR5 152 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DHDHQ9UQ10 334 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GVI7 797 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CIB4A0PJX0 185 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 NOTOA8MTQ0 251 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 MSTNO14793 375 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CD37P11049 281 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PSKH1P11801 424 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 B4GALT1P15291 398 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF32P17041 273 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.066e-8■■■■□ 21.2
HDLBP-211ENST00000425989 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 KIR3DL2P43630 455 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CX3CR1P49238 355 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SCAND1P57086 179 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RAB1AP62820 205 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PGAP1Q75T13 922 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DOK3Q7L591 496 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ASB5Q8WWX0 329 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 STARD4Q96DR4 205 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PGAM5Q96HS1 289 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR10A2Q9H208 303 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TPK1Q9H3S4 243 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C12orf49Q9H741 205 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RTTNQ86VV8 2226 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CLDN25C9JDP6 229 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 E9PLN8 166 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 M0R135 149 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 XRCC2O43543 280 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SYT7O43581 403 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DOK2O60496 412 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TNFSF13O75888 250 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TPPPO94811 219 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 WNT11O96014 354 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CGAP01215 116 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TTRP02766 147 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CCL1P22362 96 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CRYGSP22914 178 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PRKXP51817 358 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 GALK2Q01415 458 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF846Q147U1 533 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 GSG1Q2KHT4 349 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RTL6Q6ICC9 239 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SPATC1Q76KD6 591 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms