RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 FSTP19883 344 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 OR3A2P47893 321 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PPP5CP53041 499 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PMP22Q01453 160 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 RAB35Q15286 201 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 HSD17B8Q92506 261 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SPTSSAQ969W0 71 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 C10orf35Q96D05 121 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 BOD1Q96IK1 185 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CEP19Q96LK0 163 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 GPR137Q96N19 417 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 OR14A2Q96R54 314 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TPK1Q9H3S4 243 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 NOX4Q9NPH5 578 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 UPB1Q9UBR1 384 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 LRBAP50851 2863 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 FREM3P0C091 2139 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0U1RQV5 110 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 OR6C6A6NF89 314 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 RER1O15258 196 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SGCEO43556 437 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 WDR1O75083 606 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CD37P11049 281 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CCL1P22362 96 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 MPGP29372 298 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 AGTR1P30556 359 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CAPZA1P52907 286 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 MXD1Q05195 221 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 INSL4Q14641 139 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 GUSBP1Q15486 140 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SLC36A2Q495M3 483 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CORO6Q6QEF8 472 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 DRAM2Q6UX65 266 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZSR3 168 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 MFSD4AQ8N468 514 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ASB5Q8WWX0 329 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 EXTL1Q92935 676 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TAAR6Q96RI8 345 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CKLFQ9UBR5 152 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 MALT1Q9UDY8 824 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 DHDHQ9UQ10 334 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0G2JK05 382 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GTH9 108 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SHISA3A0PJX4 238 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ISPDA4D126 451 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CTDSP2O14595 271 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PIN1P1O15428 100 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TPPPO94811 219 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TGM6O95932 706 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 FAM87AP0C7U9 286 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 EPXP11678 715 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 BMP4P12644 408 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TNFSF8P32971 234 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ARR3P36575 388 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CX3CR1P49238 355 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TPTEP56180 551 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TGFBR3Q03167 851 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CEP78Q5JTW2 689 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SPATC1Q76KD6 591 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 LINGO2Q7L985 606 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms