RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 GAAP10253 952 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SRD5A1P18405 259 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 POU1F1P28069 291 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CRYBB2P43320 205 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ERFP50548 548 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MMP15P51511 669 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A1P53007 311 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RAD23AP54725 363 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CDH15P55291 814 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM33P57088 247 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TEKQ02763 1124 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 KCNMB1Q16558 191 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 FAM209AQ5JX71 171 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 USP51Q70EK9 711 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR4K13Q8NH42 304 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A6Q92536 515 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf159Q96HA4 380 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TSSK2Q96PF2 358 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 NMNAT3Q96T66 252 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 POFUT1Q9H488 388 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 NTN4Q9HB63 628 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 S100A14Q9HCY8 104 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CMC2Q9NRP2 79 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 B4DSR2 109 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN25C9JDP6 229 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 WNT9BO14905 357 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RER1O15258 196 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SPRY3O43610 288 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SOX14O95416 240 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ADH4P08319 380 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DBHP09172 617 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TUBG1P23258 451 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LIPAP38571 399 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RGS6P49758 472 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH3A2P51648 485 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MVKQ03426 396 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ECH1Q13011 328 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PSG7Q13046 419 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MEP1BQ16820 701 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CR1LQ2VPA4 569 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HFEQ30201 348 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 AVPI1Q5T686 147 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR6V1Q8N148 313 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GJC3Q8NFK1 279 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 COG8Q96MW5 612 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DIRC2Q96SL1 478 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 VCXQ9H320 206 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 FN3KQ9H479 309 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MSL2Q9HCI7 577 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 USE1Q9NZ43 259 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TREM2Q9NZC2 230 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 B9D1Q9UPM9 204 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CACNG2Q9Y698 323 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR6C68A6NDL8 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SNTNA6NMZ2 147 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RNF212BA8MTL3 300 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 FAM157AC9JC47 383 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 H0YHG0 523 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 H3BNX3 289 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 J3QL48 77 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 J3QW42 95 aa6.5□□□□□ -1.37
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