RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SEC22AQ96IW7 307 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SOWAHBA6NEL2 793 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GPX5O75715 221 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PGA4P0DJD7 388 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PGA5P0DJD9 388 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CRISP2P16562 243 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ARRB2P32121 409 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GPM6BQ13491 265 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 VRK2Q86Y07 508 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PP6455Q8WZ26 134 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 S1PR5Q9H228 398 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 JMJD7P0C870 316 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GJA4P35212 333 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ARSDP51689 593 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 FAM3AP98173 230 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RAB6CQ53S08 254 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MAVSQ7Z434 540 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GATSQ8NAP1 163 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NEURL2Q9BR09 285 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RSG1Q9BU20 258 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 BANF2Q9H503 90 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PSENENQ9NZ42 101 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 R4GMQ9 66 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 LAMB2P55268 1798 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 FCN1O00602 326 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TBX18O95935 607 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 HPP00738 406 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 INHBBP09529 407 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 HRH1P35367 487 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ARR3P36575 388 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 P2RY1P47900 373 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 DUSP5Q16690 384 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR8D4Q8NGM9 314 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TPPP3Q9BW30 176 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PPM1DO15297 605 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 STC2O76061 302 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 HLA-DRB3P79483 266 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PSMG4Q5JS54 123 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF573Q86YE8 665 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ACY3Q96HD9 319 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 BCL2L10Q9HD36 194 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PRAMEF4O60810 478 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 IGFBP7Q16270 282 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 DOLPP1Q86YN1 238 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PEX11GQ96HA9 241 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ISLRO14498 428 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SH2D1BO14796 132 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF17P17021 662 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NTF3P20783 257 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 DIO1P49895 249 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PMCHL1Q16048 86 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OCEL1Q9H607 264 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 HSD17B6O14756 317 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NXPH2O95156 264 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PTNP21246 168 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 DUSP8Q13202 625 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CST6Q15828 149 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TXNDC8Q6A555 127 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 Q7L0L9 218 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 IGSF21Q96ID5 467 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 CSF3RQ99062 836 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms