RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB24Q969Q5 203 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF805Q5CZA5 627 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXL18Q96ME1 805 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 PIAS3Q9Y6X2 628 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 F5H697 171 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 C2orf27AQ580R0 203 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 LILRA2Q8N149 483 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 OR1J2Q8NGS2 313 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 SCMH1Q96GD3 660 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 MMP24Q9Y5R2 645 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A087WV62 115 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM210A6NLX4 147 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC18Q8N456 261 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 OR5B21A6NL26 309 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 CD1DP15813 335 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 OSTM1Q86WC4 334 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF28P17035 718 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 BMP5P22003 454 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 HTR1FP30939 366 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 TXNDC8Q6A555 127 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 LSMEM1Q8N8F7 131 aa10.28□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf226A1L170 272 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 OPN1MWP04001 364 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 OPN1MW2P0DN77 364 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 OPN1MW3P0DN78 364 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 CD40P25942 277 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 NHSL2Q5HYW2 709 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 RTP4Q96DX8 246 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 VWA8A3KMH1 1905 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 PRRX1P54821 245 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 PAX5Q02548 391 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 MIDNQ504T8 468 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF2Q99496 336 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF385DQ9H6B1 395 aa10.27□□□□□ -0.76
HDGFL3-201ENST00000299633 GPRIN2O60269 458 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 PDE7AQ13946 482 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 CLDN22Q8N7P3 220 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 SDR9C7Q8NEX9 313 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 SNX22Q96L94 193 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 NDUFB11Q9NX14 153 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 GLTPD2A6NH11 291 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 TNFRSF10CO14798 259 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 UTS2O95399 124 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 MMP15P51511 669 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 LIPNQ5VXI9 398 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 DRAM2Q6UX65 266 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 PDZD3Q86UT5 571 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM210BQ96KR6 192 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 BCL2L11O43521 198 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 ACRV1P26436 265 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2G6Q5TZ20 316 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 CALHM1Q8IU99 346 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 OIT3Q8WWZ8 545 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 SIRT7Q9NRC8 400 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNK6Q9Y257 313 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 POP7O75817 140 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 CCL14Q16627 93 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 MAJINQ3KP22 176 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 RABEPKQ7Z6M1 372 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 CNTD2Q9H8S5 307 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 NAGKQ9UJ70 344 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 BCORQ6W2J9 1755 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 SIGLEC6O43699 453 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS1P07477 247 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 CD200P41217 278 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 LGALS4P56470 323 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 OR10P1Q8NGE3 313 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 DUX1O43812 170 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 RPL12P30050 165 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 RAD52P43351 418 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC35A1P78382 337 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 ABHD4Q8TB40 342 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.27□□□□□ -0.77
HDGFL3-201ENST00000299633 VN1R3Q9BXE9 311 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms