RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ADAM12O43184 909 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 THADAQ6YHU6 1953 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RAB1AP62820 205 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FAM166BA8MTA8 275 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR2C1O95371 312 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR13C7P0DN81 318 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RFC3P40938 356 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM235A6NFC5 223 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SPI1P17947 270 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 IVDP26440 423 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DHODHQ02127 395 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR5AS1Q8N127 324 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR5H8P0DN80 308 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CAPZBP47756 277 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SSX9Q7RTT3 188 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GPX8Q8TED1 209 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CTNSO60931 367 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MEOX1P50221 254 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DUSP6Q16828 381 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC39A7Q92504 469 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PECRQ9BY49 303 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ACOT8O14734 319 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM127O75204 238 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ST8SIA2Q92186 375 aa8.52□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TGOLN2O43493 480 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 BEX5Q5H9J7 111 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 IFI44Q8TCB0 444 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DBX1A6NMT0 343 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TNFRSF10CO14798 259 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 XRCC2O43543 280 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MARCH3Q86UD3 253 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GPR84Q9NQS5 396 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NSG2Q9Y328 171 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 R4GMQ9 66 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SELENOFO60613 162 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FGF7P21781 194 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FCGR2CP31995 323 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 HCCSP53701 268 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 EDEM2Q9BV94 578 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LRP6O75581 1613 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR2M3Q8NG83 312 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ST8SIA1Q92185 356 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OXGR1Q96P68 337 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 QDPRP09417 244 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ACSM4P0C7M7 580 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TM4SF4P48230 202 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PLA1AQ53H76 456 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 AGBL4Q5VU57 503 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 S1PR5Q9H228 398 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SERPINE3A8MV23 424 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FUT6P51993 359 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZNF384Q8TF68 577 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 EGLN2Q96KS0 407 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC29A1Q99808 456 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 H3F3AP84243 136 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FBXO27Q8NI29 283 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PELI1Q96FA3 418 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms