RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 ZER1Q7Z7L7 766 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 ZNF283Q8N7M2 679 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 BBS10Q8TAM1 723 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SLC25A40Q8TBP6 338 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CYGBQ8WWM9 190 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 RAB40AQ8WXH6 277 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 BORCS5Q969J3 196 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SAMD8Q96LT4 415 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CHIAQ9BZP6 476 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 OR2J1Q9GZK6 312 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 MARCH7Q9H992 704 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 DCAF16Q9NXF7 216 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 RPS6KA6Q9UK32 745 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.05□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 C5orf49A4QMS7 147 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 EVPLLA8MZ36 301 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 C5orf58C9J3I9 102 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CXCR6O00574 342 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 TSPAN15O95858 294 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 WNT2P09544 360 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CRHBPP24387 322 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 GDI2P50395 445 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 GZMMP51124 257 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 ARHGDIAP52565 204 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 ZMYND11Q15326 602 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 C2orf68Q2NKX9 166 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 GPR157Q5UAW9 335 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 REC114Q7Z4M0 266 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 ZNF101Q8IZC7 436 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 LRRC18Q8N456 261 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 LINC01006Q8NI28 216 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 TBC1D15Q8TC07 691 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 DYRK2Q92630 601 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 POM121L2Q96KW2 1035 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 ARHGDIGQ99819 225 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 TMEM43Q9BTV4 400 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 MSL2Q9HCI7 577 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SLC6A13Q9NSD5 602 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 VAPAQ9P0L0 249 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 C5orf63A6NC05 138 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 LRRN3E7EW58 273 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SURF4O15260 269 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 RNF13O43567 381 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 IGHG1P01857 330 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 GNAO1P09471 354 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PGA4P0DJD7 388 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PGA3P0DJD8 388 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 GPX2P18283 190 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CLRN1P58418 232 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PPP1CBP62140 327 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 GNB2P62879 340 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PAX2Q02962 417 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CDK5R2Q13319 367 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 OR1Q1Q15612 314 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SPRNQ5BIV9 151 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 ARL9Q6T311 187 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 FNDC8Q8TC99 324 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PYURFQ96I23 114 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 SIAEQ9HAT2 523 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 FAM118AQ9NWS6 357 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 TANC2Q9HCD6 1990 aa10.03□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 A0A0B4J2E0 115 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GX12 115 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 H3BMQ9 156 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 IFNL4K9M1U5 179 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 CST1P01037 141 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 HIST1H2ABP04908 130 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 RPS2P15880 293 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 WNT5AP41221 380 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 PROK1P58294 105 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 MELKQ14680 651 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 TMEM255AQ5JRV8 349 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 C6orf141Q5SZD1 244 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZPA2 131 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa10.02□□□□□ -0.8
SPC25-201ENST00000282074 KRT73Q86Y46 540 aa10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms