RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 IP6K3Q96PC2 410 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 INTS14Q96SY0 518 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PRO1933Q9H354 126 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PPC4 97 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 COLCA2A8K830 154 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TSPAN15O95858 294 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SPARCP09486 303 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ELOCQ15369 112 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF529Q6P280 563 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 WNT16Q9UBV4 365 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 DHDHQ9UQ10 334 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CDC14CA4D256 554 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EFCAB7A8K855 629 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ADAP1O75689 374 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 NGFRP08138 427 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CD1CP29017 333 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CMPK1P30085 196 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GLP1RP43220 463 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 LILRB2Q8N423 598 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 RAB3CQ96E17 227 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SEH1LQ96EE3 360 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 VEGFDO43915 354 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 LILRB5O75023 590 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TXNDC12O95881 172 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PMP2P02689 132 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV4-34P06331 123 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CTSBP07858 339 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 HSD17B2P37059 387 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 RABIFP47224 123 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EMDP50402 254 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TOMM20Q15388 145 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 VWA2Q5GFL6 755 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 Q6ZRG5 221 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 LYG2Q86SG7 212 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 VSIG4Q9Y279 399 aa9.75□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 NME2P1O60361 137 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJB6O75190 326 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GLCEO94923 617 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ITGB2P05107 769 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 LAP3P28838 519 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ECH1Q13011 328 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF345Q14585 488 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 COL19A1Q14993 1142 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 HLA-BQ31612 363 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ACTBL2Q562R1 376 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 AWAT1Q58HT5 328 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 KIRREL1Q96J84 757 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 WDR76Q9H967 626 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms